对受益人的作用：为其提供了一种有效的风险保障机制。在交易或项目中，受益人往往面临着申请人不履行义务的风险，保函的存在使得受益人在申请人违约时能够通过向担保人索赔来获得经济上的补偿，从而保障其合法权益。
与保证的区别：保证通常是一种人的担保，主要依赖保证人的信用和偿债能力；而保函除了人的担保外，还往往与银行等金融机构的信用和资金实力相关，具有更强的可靠性和独立性。在法律关系上，保证一般是从属于主债权债务关系的从合同，而保函在一定程度上具有独立性，即使基础交易出现问题，只要保函的索赔条件成就，受益人通常仍有权向担保人索赔。
双方意愿：申请人和受益人作为保函的主要利益相关方，若基于自身利益考虑和实际业务情况，经协商达成一致，就可以对保函期限进行调整。例如，申请人希望缩短保函期限以减少担保责任时间，而受益人在评估风险后也同意，那么就可以进行相应调整。
从常见商业实践看
在实际商业活动中，预付款保函期限超过预付款使用期限是较为常见的做法。一般会根据合同的整体期限、项目的复杂程度等因素来综合确定保函期限。比如在一些大型设备采购项目中，预付款使用期限可能在设备生产阶段，但保函期限通常会延长至设备交付后的一定质保期内，以保证在整个交易过程中受益人的权益都能得到有效保障。